Усадьба Афинеево за всю свою историю сменила множество владельцев. Известно, что одним из первых ее владельцев был М.А. Протасьев. Это была их вотчина с усадебными строениями. От этого периода сохранилась только кирпичная церковь Иоанна Предтечи
(1704-1709), построенная в стиле московского барокко, колокольня псевдоготической архитектуры и северный портик храма. Доподлинно известно, что третьим по счету
помещиком этих земель был дворянин Ступишин. Благодаря ему в Афинеево появился липовый парк, искусственные пруды с ажурными мостиками и главный господский дом, построенный в классическом стиле. Затем Афинеево перешло к издателю и редактору
журнала "Отечественные записки" Свиньину, который в усадьбе практически не жил и продал ее купцу Власову.
И наконец в 1913 году полноправным владельцем усадьбы становится известный коллекционер Бахрушин, основатель первого в мире театрального музея, открывшегося в Москве в конце XIX в. Алексей Александрович Бахрушин в молодости на спор начал
собирать театральные реликвии, а потом это сделалось главным увлечением его жизни. Впервые он показал свою коллекцию друзьям в 1894 г. Именно эта дата и стала годом основания музея.
Бахрушин предложил Московской городской думе и городской Управе принять в дар городу Москве его театральную коллекцию и создать театральный музей, но получил отказ и в 1913 г. передал свою коллекцию - 12 тысяч экспонатов - Российской академии
наук. По совету А.В. Луначарского В.И. Ульянов-Ленин разрешил назначить Бахрушина пожизненным директором музея и оставить за музеем его имя. В Афинееве дом Бахрушина не сохранился, однако сохранилась древняя церковь, около которой он стоял.
Эта кирпичная церковь Иоанна Предтечи была построена в 1704-1709 гг. в стиле московского барокко. Сохранилась также ее колокольня псевдоготической архитектуры
(рубежи ХVIII-ХIХ вв.).
